長崎県長崎市に鎮座する、諏訪神社（すわじんじゃ）は、鎮西大社といわれ、諏訪大神、森崎大神、住吉大神を祀る長崎の総氏神様である。
　弘治年間（１５５５～１５５７年）に信濃の諏訪神社から分霊し、諏訪神社が建立されていたが、領主のキリシタン大名大村純忠は長崎をイエズス会の知行地として寄進し、市内の神社仏閣はほとんど破壊されてしまった。しかし、寛永元（１６２４）年に肥前唐津の宮司、青木賢清（あおきけんせい）の努力により諏訪神社、森崎神社、住吉神社を合祀して再興。慶安元（１６４８）年に現在の場所に社殿が造営された。安政四（１８５７）年に火災によりほとんど焼失したが明治二（１８６９）年に１０年の歳月を費やして社殿が再興された。昭和五九（１９８４）年には御鎮座三百六十年祭を記念して昭和の大改修が執り行われ、現在の社殿の姿となっている。
　地元では「お諏訪さま」と呼ばれ、毎年秋には日本三大祭の一つである長崎くんちが開催される。